Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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