Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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