Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms