Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SHPRHQ149N8 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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