Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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