Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms