| RUNX2 | Q13950 | AC008505.1-204 | ENST00000637363 | 2714 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CPXCR1-202 | ENST00000373111 | 1577 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE3A-202 | ENST00000397954 | 2873 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RTN4-208 | ENST00000404909 | 4102 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PHC3-215 | ENST00000495893 | 12666 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PKIB-202 | ENST00000354275 | 1043 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-181P-201 | ENST00000363225 | 107 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1103P-201 | ENST00000384150 | 107 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-39P-201 | ENST00000384344 | 107 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P8-201 | ENST00000391458 | 268 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5H8-201 | ENST00000394191 | 1045 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC110754.1-201 | ENST00000399740 | 601 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GSTA9P-201 | ENST00000406231 | 611 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P8-201 | ENST00000406997 | 288 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-36P-201 | ENST00000410361 | 191 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS27L-202 | ENST00000411926 | 528 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P24-201 | ENST00000413752 | 448 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP4-201 | ENST00000420090 | 333 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C8orf59P1-201 | ENST00000429930 | 303 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCDH9-AS1-201 | ENST00000430861 | 532 nt | TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P4-201 | ENST00000435196 | 415 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL451074.3-201 | ENST00000437709 | 472 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL662791.1-201 | ENST00000441992 | 928 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NOTCH2P1-201 | ENST00000443481 | 624 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P1-201 | ENST00000445453 | 368 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136380.1-201 | ENST00000447970 | 162 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC132479.1-201 | ENST00000449160 | 144 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ITGA9-AS1-208 | ENST00000449586 | 726 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SRRM1P2-201 | ENST00000464531 | 1192 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPGP3-201 | ENST00000469405 | 227 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD7-204 | ENST00000477532 | 744 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD36B-207 | ENST00000497329 | 649 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LEF1-218 | ENST00000512172 | 598 nt | TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ABCA17P-206 | ENST00000512848 | 467 nt | TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCARNA24.1-201 | ENST00000516465 | 137 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-445P-201 | ENST00000516949 | 107 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02365-202 | ENST00000520280 | 607 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ERHP1-201 | ENST00000523006 | 310 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003072.2-201 | ENST00000527756 | 676 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HOMER1-205 | ENST00000535690 | 642 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MGST1-215 | ENST00000540056 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC078962.4-201 | ENST00000546135 | 254 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023824.4-201 | ENST00000562572 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL391646.1-201 | ENST00000603860 | 190 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00310-205 | ENST00000609062 | 863 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012531.5-201 | ENST00000611375 | 151 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121772.2-201 | ENST00000614331 | 297 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073172.1-201 | ENST00000636967 | 851 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC77P-213 | ENST00000637727 | 880 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLS3-203 | ENST00000420625 | 3150 nt | TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF415-207 | ENST00000595193 | 2479 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CASP1-210 | ENST00000528974 | 1402 nt | TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPA8P1-201 | ENST00000425843 | 1833 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIS12-201 | ENST00000381165 | 2505 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTAR1-202 | ENST00000377200 | 9876 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090740.1-201 | ENST00000623193 | 2262 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM111A-207 | ENST00000531147 | 3996 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC39-203 | ENST00000370138 | 1466 nt | TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.22-201 | ENST00000362492 | 102 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U3.11-201 | ENST00000364476 | 212 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359837.1-201 | ENST00000381357 | 287 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-517P-201 | ENST00000384362 | 110 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR134-201 | ENST00000385258 | 73 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRDJ1-201 | ENST00000390473 | 51 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | STAP1-202 | ENST00000396225 | 1146 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359634.1-202 | ENST00000404721 | 284 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-62P-201 | ENST00000410868 | 191 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFB1P1-201 | ENST00000435191 | 180 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF228730.2-201 | ENST00000438784 | 848 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025428.1-201 | ENST00000444137 | 403 nt | TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CASP1-203 | ENST00000446369 | 948 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005538.1-201 | ENST00000455991 | 594 nt | TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010631.1-201 | ENST00000474150 | 156 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P6-201 | ENST00000479457 | 291 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2CP3-201 | ENST00000502715 | 450 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P29-201 | ENST00000505659 | 499 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB3P15-201 | ENST00000507326 | 574 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFB4P9-201 | ENST00000511646 | 388 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010468.2-201 | ENST00000511981 | 438 nt | TSL 2 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-61P-201 | ENST00000516107 | 151 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA70.16-201 | ENST00000516390 | 95 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP209-201 | ENST00000516888 | 304 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026894.1-202 | ENST00000533843 | 477 nt | TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC133480.1-201 | ENST00000547563 | 381 nt | TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SYF2P1-201 | ENST00000550658 | 413 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009803.1-201 | ENST00000551531 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087883.1-201 | ENST00000551882 | 391 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF099810.1-201 | ENST00000554219 | 525 nt | TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CERS3-AS1-202 | ENST00000560718 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C16orf97-203 | ENST00000566314 | 281 nt | TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007493.1-202 | ENST00000567899 | 517 nt | TSL 2 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008277.2-201 | ENST00000605196 | 797 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161734.1-201 | ENST00000609720 | 557 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR486-1-201 | ENST00000612171 | 68 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356130.2-201 | ENST00000612554 | 404 nt | TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02086-205 | ENST00000628749 | 679 nt | TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092442.1-201 | ENST00000636216 | 138 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092017.3-201 | ENST00000638880 | 536 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRMP-221 | ENST00000636465 | 4540 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF66-201 | ENST00000344519 | 1745 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |