Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms