Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1SQ13698 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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