Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATRQ13535 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATRQ13535 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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