Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TCOF1Q13428 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TCOF1Q13428 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms