Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATMQ13315 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
ATMQ13315 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATMQ13315 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATMQ13315 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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