Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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