Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIN2AQ12879 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms