Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms