Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CENPEQ02224 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms