Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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