Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHF1O43189 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHF1O43189 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PHF1O43189 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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