Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
RFXAPO00287 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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RFXAPO00287 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RFXAPO00287 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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