Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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