Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
RBM42Q9BTD8 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RBM42Q9BTD8 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms