Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMG1Q96Q15 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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