Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ZBED3Q96IU2 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZBED3Q96IU2 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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