Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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BCANQ96GW7 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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BCANQ96GW7 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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BCANQ96GW7 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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BCANQ96GW7 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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