Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTN1Q16799 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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RTN1Q16799 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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RTN1Q16799 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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RTN1Q16799 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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