Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ECM1Q16610 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ECM1Q16610 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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