Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNAPC1Q16533 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SNAPC1Q16533 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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SNAPC1Q16533 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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SNAPC1Q16533 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SNAPC1Q16533 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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SNAPC1Q16533 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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