Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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