Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms