Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms