Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USF2Q15853 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USF2Q15853 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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