Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRADDQ15628 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms