Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1CQ15572 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms