Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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SIX1Q15475 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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SIX1Q15475 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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SIX1Q15475 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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