Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SYCP1Q15431 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SYCP1Q15431 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SYCP1Q15431 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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