Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms