Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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