Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMC1AQ14683 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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