Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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APOFQ13790 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
APOFQ13790 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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