Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDH18Q13634 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms