Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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SEMA3FQ13275 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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SEMA3FQ13275 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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SEMA3FQ13275 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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SEMA3FQ13275 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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SEMA3FQ13275 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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