Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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