Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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