Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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GRIN2AQ12879 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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GRIN2AQ12879 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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GRIN2AQ12879 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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GRIN2AQ12879 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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GRIN2AQ12879 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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GRIN2AQ12879 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2AQ12879 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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