Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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KCNMA1Q12791 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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KCNMA1Q12791 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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KCNMA1Q12791 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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KCNMA1Q12791 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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KCNMA1Q12791 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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