Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFFO1Q0D2I5 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms