Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CACNB1Q02641 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms