Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CENPEQ02224 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CENPEQ02224 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms