Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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HOXD10P28358 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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HOXD10P28358 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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