Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms